Для начала нужно заполнить настройки:

"Настройки отчета комиссионера"

Не забываем сохранять настройки после заполнения.

Далее:

Далее "Создать обновить документ". Для того чтобы система могла выбрать и обновить документ, если такой есть, то нужно чтобы в табличной части был только 1 документ или совсем их не было за данный период времени.